in1975, а self и не будет обрабатываться. Он же просто вхолостую туда декриптуется и там валяется, главное чтобы не заменился ELF. А далее прога определяет, что там в папке лежит ELF и больше не пытается декриптовать. Ну там в батнике можно найти тыщу мест, где что-то подхимичить. Да и зачем лепить отдельный батник, если это такой частный случай.
Ang3l42, ну да, проще паузу перед щифрованием поставить и как только консоль встанет на паузу, идём в папку scetool и подменяем ELF, а после паузы уже подпишется другой ELF. Или там же в папке правим читы в этот декриптованный ELF и потом подписываем.