E2E41, то есть, ты уже проверял, изменив запускается из одной папки, а не меняя - не запускается?
У меня пока руки не дошли, чтобы заглянуть в EBOOT, всё не до этого.
А при переподписи сравнивал разницу, может там нет просто заголовка SCE или ещё чего не хватает.